مرا به خاطر بسپار

Colabfold - A100G32C96R2500D

تعرفه آزاد هر ساعت: 1,218,100 ریال حداقل اعتبار مورد نیاز: 29,234,400 ریال

لطفا اطلاعات زیر را در متن پیام تیکت وارد نمایید:
- نام خدمت: Colabfold - A100G32C96R2500D
- زمان مورد نیاز: تعداد ساعت (حداقل 24)
سرویس ابری پردازش فوق سریع لینوکس اوبونتو مرکز ابررایانه ملی سیمرغ، Linux-Ubuntu-CPU-Service-IaaS، Simorgh-HPC
  • پردازنده گرافیکی:nvidia Ampere A100
  • حافظه گرافیکی: 40 گیگابایت
  • تعداد هسته پردازشی مجازی: 32 عدد
  • فرکانس پایه پردازنده: 2.6 گیگاهرتز
  • ظرفیت حافظه اصلی: 96 گیگابایت
  • ظرفیت هارد دیسک: 2500 گیگابایت
  • حداقل اعتبار موردنیاز: 29,234,400 ریال
: منظور از هر هسته پردازشی مجازی، Thread است
: حافظه اصلی (RAM) از نوع DDR4 است.
: ابزار الفا فولد 2 یک ابزار پیشگویی ساختار سه بعدی پروتئین است که در مسابقه معروف CASP14 بیشترین دقت نسبت به سایر ابزارها برای پیشگویی ساختار سه بعدی پروتئین کسب کرده است. ColabFold نیز بر پایه الفا فولد 2 است که سریع تر است و امکان پیش گویی حدود 1000 ساختار را در هر روز فراهم کرده است. مسئله اصلی برای استفاده از این ابزار، وجود یک سیستم با GPU قدرتمند و میزان حافظه رم بالا است. بسیاری از پژوهشگران بیوانفورماتیک در ایران و دنیا مشتاق استفاده از ابزار ColabFold هستند. این خدمت یک بسته کامل برای اجرای نرم‌افزار کولب فولد است که شامل نرم‌افزارهای زیر می‌باشد:
  • Colabfold 1.5.2
  • AnaConda
همچنین مجموعه داده (dataset) زیر به صورت رایگان بر روی سیستم موجود است:
  • uniref30_2202
  • colabfold_envdb_202108
  • pdb70_220313.fasta
  • pdb70_from_mmcif_220313